截止2016年底，吐鲁番市森林面积为346.78万亩，森林覆盖率为3.31%，绿洲覆盖率为18.52%。
全市森林资源主要由北部天山天然针阔叶林，分布在山前、沙漠、绿洲外围的荒漠灌木林和平原绿洲人工林三大部分组成。
--山区天然针阔叶林16万亩，主要树种是云杉、山杨、山柳等，分布在高昌和鄯善北部天山，是重要的水土保持林和水源涵养林。
--荒漠灌木林201万亩，主要树种是梭梭、麻黄、红柳等灌木林，分布在山前、沙漠、绿洲外围，是绿洲的天然屏障。
--平原绿洲人工林129.78万亩，分为防护林(主要是农田防护林和固沙林)、经济林，是绿洲防护林体系的主体。其中农田防护林 9.48万亩、固沙林40万亩。
   全市露地林果种植总面积80.3万亩，其中葡萄54.2万亩(露地葡萄47.5万亩，酿酒葡萄6.7万亩)，占全疆葡萄种植总面积的34.3%，红枣14万亩，杏7.4万亩，桑树2.9万亩，其它1.8万亩。