我校与香港和澳门地区大学的交流与合作有良好的人文和社会基础，2000年，我校与“香港普通话天地”合作，积极参与香港特别行政区推动的普通话学习计划，在香港开设了以服务香港中小学教师为主的普通话培训班，先后有1000多人次参加培训。 2009年，我校与香港城市大学签订了“香港城市大学专上学院与广州大学环境科学与工程学院环保学人才培养合作项目”合作协议。此项目为香港城市大学环保学专业学生提供实验课学习条件，协助香港地区的大学开展环境保护专门的人才培养，开创了香港地区的大学与内地的大学之间资源共享的模式。
为了配合澳门特区政府推动博彩服务人员培养和培训计划，2002年，我校与澳门理工学院在澳门合作开设了“机电维修工程”本科教育项目，同时开设了与之相关的培训班，培养了大批服务博彩行业的机电专业技术人才。
      2007年开始，“穗台校长论坛”先后三次在我校举行。由台湾义守大学校长傅胜利率领的台湾高校校长参访团全体成员参加了论坛，与穗广州地区各大校校长代表围绕穗台两地高等教育的现状及发展等问题进行，并在提升两地的教育素质、培养高素质的人才、促进区域社会发展发挥等方面坦率地交换意见。 台湾校长代表团团长指出，本届论坛与往届不同之处是特别邀请了台湾中南北三部，包括国立、私立大学在内的高校随团访问。与会代表表示，穗台两地的高校将借此契机，加强交流和合作，探索资源共享，共存共荣的合作模式。
     2008年，“广州大学-淡江大学工程结构灾害与控制联合研究中心”正式成立，开创了两岸高等院校的科研合作先例。此项目是台湾当局教育行政主管部门第一个批准的与大陆进行科研合作的项目，引起台湾领导人、工程教育和研究界人士的关注。2009年9月，经专家评审，该联合研究中心被广东省科技厅授予“广东省国际科技合作示范基地”。